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Conference papers
Gestion et valorisation des carottes sédimentaires à but scientifique en France : vers un système intégré
Cécile Pignol
1
Fabien Arnaud
1
Julien Ancelin
Laurent Augustin
2
Karim Bernardet
2
Isabelle Billy
3
Arnaud Caillo
4
Michel Calzas
5
Xavier Crosta
3
Maxime Debret
6
Franck Delalee
7
Anne-Lise Develle
8
O. Evrard
9
Bruno Galabertier
1
Elodie Godinho
4
Cécile Grosbois
10
Wilfried Heintz
11
Brice Mourier
12
Christine Plumejeaud
13
Eric Quinton
14
Mathias Rouan
15
Pierre Stéphan
15
Pierre Sabatier
1
Grafenstein U. Von
9, 16
Vincent Bretagnolle
Denis-Didier Rousseau
6
4
C2FN
12
Impacts des Polluants sur les Écosystèmes
LEHNA - Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
15
LETG - Brest - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique
LETG - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554
16
GEOTRAC - Géochrononologie Traceurs Archéométrie
LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] : DRF/LSCE
Cécile Pignol 1
Mail :
Author IdHAL : cecile-pignol IdRef : https://www.idref.fr/113360193 ORCID : https://orcid.org/0000-0003-4411-8898
Fabien Arnaud 1
Mail :
Author IdHAL : fabien-arnaud ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/F-7003-2012 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8706-9902
Julien Ancelin
Mail :
Author
Laurent Augustin 2
Author
Karim Bernardet 2
Author
Isabelle Billy 3
Author
Arnaud Caillo 4
Mail :
Author IdHAL : arnaud-caillo ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6583-6744
Michel Calzas 5
Author
Xavier Crosta 3
Author
Maxime Debret 6
Mail :
Author IdHAL : maxime-debret ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/L-4236-2017 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8852-0152
Franck Delalee 7
Author
Anne-Lise Develle 8
Mail :
Author IdHAL : anne-lise-develle ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2824-4106
O. Evrard 9
Mail :
Author IdHAL : olivierevrard ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/E-5076-2011 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3503-6543
Bruno Galabertier 1
Author
Elodie Godinho 4
Author
Cécile Grosbois 10
Mail :
Author IdHAL : cecile-grosbois IdRef : https://www.idref.fr/152548769
Wilfried Heintz 11
Mail :
Author IdHAL : wilfried-heintz ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9244-9766
Brice Mourier 12
Author
Christine Jacques Plumejeaud 13
Author
Eric Quinton 14
Mail :
Author IdHAL : eric-quinton ORCID : https://orcid.org/0000-0003-4207-4107
Mathias Rouan 15
Mail :
Author IdHAL : mathias-rouan
Pierre Stéphan 15
Mail : Site :
Author IdHAL : pierre-stephan ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7975-2149
Pierre Sabatier 1
Mail :
Author IdHAL : pierre-sabatier ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9620-1514
Grafenstein U. Von 9, 16
Author
Vincent Bretagnolle
Author
Denis-Didier Rousseau 6
Author
1
EDYTEM - Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne (Université de Savoie, Campus scientifique, 73376 Le Bourget du Lac cedex - France)
- USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] - Université Savoie Mont Blanc (27, rue Marcoz - 73000 Chambéry - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5204 (France)
2
DTI - Division technique INSU/SDU (1, Place Aristide Briand 92195 MEUDON CEDEX - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UPS855 (France)
3
EPOC - Environnements et Paléoenvironnements OCéaniques (Avenue des Facultés - 33405 TALENCE CEDEX - France)
- OASU - Observatoire aquitain des sciences de l'univers (0ASU - Site de Floirac 2 rue de l'Observatoire - BP 89 33270 FLOIRAC - France)
- Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (351 cours de la Libération - 33405 Talence cedex - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMS2567 (France)
- Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (351 cours de la Libération - 33405 Talence cedex - France)
- EPHE - École pratique des hautes études (4-14 Rue Ferrus, 75014 Paris - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5805 (France)
4
C2FN (France)
6
LMD - Laboratoire de Météorologie Dynamique (UMR 8539) (LMD ENS 24 Rue Lhomond 75231 Paris Cedex 05 - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- X - École polytechnique (École polytechnique, 91128 Palaiseau Cedex - France)
- ENPC - École des Ponts ParisTech (École des Ponts ParisTech 6-8 avenue Blaise-Pascal Cité Descartes 77455 Champs-sur-Marne Marne-la-Vallée cedex 2 - France)
- SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8539 (France)
- Département des Géosciences - ENS Paris (24 rue Lhomond, 75005 Paris, France - France)
- ENS Paris - École normale supérieure - Paris (45, Rue d'Ulm - 75230 Paris cedex 05 - France)
7
OASU - Observatoire aquitain des sciences de l'univers (0ASU - Site de Floirac 2 rue de l'Observatoire - BP 89 33270 FLOIRAC - France)
- Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (351 cours de la Libération - 33405 Talence cedex - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMS2567 (France)
8
LCE - Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (UFR Sciences et Techniques - 16, route de Gray - 25030 Besançon Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6249 (France)
- UFC - Université de Franche-Comté (France)
- UBFC - Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (France)
9
LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (Bât. 12,
avenue de la Terrasse,
F-91198 GIF-SUR-YVETTE CEDEX
- France)
- UVSQ - Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines : UMR8212 (55 avenue de Paris - 78035 Versailles cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF/LSCE (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers : UMR8212 (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8212 (France)
10
GRESE - Groupement de Recherche Eau, Sol, Environnement (Faculté des sciences et techniques 123 Avenue Albert THOMAS 87060 LIMOGES - France)
- UNILIM - Université de Limoges : EA4330 (33 rue François Mitterrand BP23204 87032 Limoges - France)
11
DYNAFOR - Dynamiques Forestières dans l'Espace Rural (France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UR1201 (France)
- École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT] (France)
- Toulouse INP - Institut National Polytechnique (Toulouse) (France)
- Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées (41 Allée Jules Guesde, 31000 Toulouse - France)
12
Impacts des Polluants sur les Écosystèmes (France)
- LEHNA - Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (Université Claude Bernard Lyon 1
3-6, rue Raphaël Dubois - Bâtiments Darwin C & Forel, 69622 Villeurbanne Cedex
43, Boulevard du 11 novembre 1918
ENTPE
3, rue Maurice Audin
69518 Vaulx-en-Velin - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : USC1369 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- ENTPE - École Nationale des Travaux Publics de l'État (3, rue Maurice Audin - 69518 Vaulx-en-Velin Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5023 (France)
13
LIENSs - LIttoral ENvironnement et Sociétés - UMRi 7266 (Bâtiment Marie Curie Avenue Michel Crépeau 17 042 La Rochelle cx1 - Bâtiment ILE 2, rue Olympe de Gouges 17 000 La Rochelle - France)
- ULR - Université de La Rochelle (Technoforum - 23 avenue Albert Einstein - BP 33060 - 17031 La Rochelle - France - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMRi7266 (France)
14
UR EABX - Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (50 avenue de Verdun - Gazinet, F-33612 Cestas - France)
15
LETG - Brest - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique (IUEM, rue Dumont d'Urville, 29280 PLOUZANE - France)
- LETG - Littoral, Environnement, Télédétection, Géomatique UMR 6554 (Institut Universitaire Européen de la Mer - Technopôle Brest-Iroise - Place Nicolas Copernic 29280 Plouzané - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 6554 (France)
- UR2 - Université de Rennes 2 (Place du recteur Henri Le Moal - CS 24307 - 35043 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- UBO - Université de Brest (Université de Bretagne Occidentale - 3 Rue des Archives 29238, Brest - France)
- EPHE - École pratique des hautes études (4-14 Rue Ferrus, 75014 Paris - France)
- UN - Université de Nantes (1, quai de Tourville - BP 13522 - 44035 Nantes cedex 1 - France)
- UA - Université d'Angers (Université d'Angers - 40 Rue de Rennes, BP 73532 - 49035 Angers CEDEX 01 - France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
16
GEOTRAC - Géochrononologie Traceurs Archéométrie (LSCE. CEA Paris-Saclay. Orme des merisiers. 91190 Saint-Aubin. - France)
- LSCE - Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] : DRF/LSCE (Bât. 12,
avenue de la Terrasse,
F-91198 GIF-SUR-YVETTE CEDEX
- France)
- UVSQ - Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines : UMR8212 (55 avenue de Paris - 78035 Versailles cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRF/LSCE (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers : UMR8212 (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8212 (France)
Résumé : Les carottes sédimentaires font l'objet d'un intérêt grandissant de la part des paléo-environnementalistes mais également d’écologues qui s'intéressent à la trajectoire des écosystèmes (Pansu et al., 2015; Perga et al., 2015). Les carottes marines ou continentales prélevées dans le cadre de consortiums internationaux (IODP, ICDP) donnent l’exemple depuis des décennies en terme de partage d’échantillons pour ce type d’étude ; plus récemment l’augmentation de ré-études massives de données publiées (Bolliet et al., 2016; Cartapan is et al., 2016) démontrent la valeur de ces échantillons et des données associées. De leur côté depuis quelques années, les législateurs et financeurs poussent à l’ouverture, au partage et à la traçabilité des données : on peut citer l’OCDE, l’UE, l’ERC... Comment notre communauté peut-elle s’inscrire au quotidien dans ces processus qui demandent de profonds changements culturels dans nos pratiques de recherche ? C’est pour tenter d’apporter une réponse à cette question que nous avons cherché à développer un système intégré de captation et de gestion des métadonnées des échantillons issus de forages scientifiques, qui puisse être implémenté au niveau national et connecté à des initiatives internationales, sur lequel pourront venir s’appuyer les futurs Plans de Gestion de Données. Par une approche bottom-up, pragmatique et au plus près des pratiques des équipes de recherche, nombreuses, dispersées, aux moyens inégaux, et en s’appuyant sur des initiatives existantes, nous tentons de répondre petit à petit à différents niveaux - de la mission de prélèvement jusqu'à leur stockage, en passant par la mise à disposition, le suivi et la valorisation des échantillons et des métadonnées qui leur sont associées. Des avancées rapides ont pu être obtenues par la rencontre entre une communauté de paléoécologues et des équipes techniques novatrices dans le domaine du partage et de l’interopérabilité mêlant des informaticiens, géomaticiens, curateurs d’échantillons et de données. Cette dynamique s’appuie sur 3 projets nationaux (Cyber-Carothèque nationale s/c Equipex CLIMCOR ANR-11-EQPX-0009 ; QR-Code LTSER- France ; ROZA LTSER-France) et s’inscrit dans le cadre du Centre de Carottage et de Forage National (C2FN), une cellule de la division technique de l’INSU. Nous présenterons dans cette intervention 4 outils qui seront à court terme interconnectés : i)CoreBOOK, une application mobile de terrain dédiée à la captation des métadonnées de forage ; ii) le portail de la cyber-carothèque national, un hub accueillant les données nouvellement acquises et les inventaires de carothèques ; iii) Collec-Science, outil générique de gestion de collections d’échantillons naturels adapté à nos besoins (s/c projet QrCODE); enfin iv) ROZA (Rétro-Observatoire des Zones Ateliers), un prototype de découvreur et visualiseur de données destiné à favoriser la réutilisation des échantillons et des données paléoenvironnementales en mettant à disposition les données essentielles à la capitalisation des connaissances d’études successives sur un même site. Les perspectives aujourd'hui sont grandes, le système modulaire qui commence à se dessiner doit permettre à chacun de trouver son compte, à son rythme, où opérationnel peut enfin rimer avec standardisation, traçabilité et interopérabilité tout en conservant une utilisabilité au plus proche des activités et besoins quotidiens des chercheurs et personnels d’accompagnement, afin d’opérer un virage en douceur vers des pratiques de la science dite « ouverte "
Document type :
Conference papers
Complete list of metadatas
https://hal-sde.archives-ouvertes.fr/hal-01887390
Contributor : Christine Maury Referent Hal Edytem <>
Submitted on : Thursday, October 4, 2018 - 9:49:28 AM
Last modification on : Thursday, August 6, 2020 - 4:34:39 PM
Contributor : Christine Maury Referent Hal Edytem <>
Submitted on : Thursday, October 4, 2018 - 9:49:28 AM
Last modification on : Thursday, August 6, 2020 - 4:34:39 PM
Identifiers
- HAL Id : hal-01887390, version 1
Collections
CNRS | UNIV-FCOMTE | UNIV-BREST | UNIV-ROCHELLE | IRSTEA | INRA | UNILIM | EPHE | UNIV-ANGERS | UVSQ | CEA | BIOENVIS | CEA-UPSAY | X-LMD | LSCE | X | ENPC | UNIV-RENNES2 | UNIV-LYON1 | UR2-HB | LETG-GEOMER | COMUE-NORMANDIE | CHRONO-ENVIRONNEMENT | INSU | ENTPE | UNIV-SAVOIE | UNIV-NANTES | GRESE | UNICAEN | EDYTEM | LETG | X-DEP-MECA | ENS-PARIS | GEIST | PEIRENE | UGA | UNIV-PARIS-SACLAY | PARISTECH | CEA-DRF | UNIV-RENNES | EDYTEM-GROUPE-ARCHIVES-ENVIRONNEMENTALES | EDYTEM-PTAR | EDYTEM-THEME-CHANGEMENTS-ENVIRONNEMENTAUX-SOCIETES | SORBONNE-UNIVERSITE | LMD | ENPC-LMD | SU-SCIENCES | UDL | IUEM | THESES_IUEM | INRAE | LSCE-CEA
Citation
Cécile Pignol, Fabien Arnaud, Julien Ancelin, Laurent Augustin, Karim Bernardet, et al.. Gestion et valorisation des carottes sédimentaires à but scientifique en France : vers un système intégré. Colloque Q11 AFEQ-CNF-INQUA, 2018, Orléans, France. ⟨hal-01887390⟩
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